O propósito deste artigo é contribuir para as reflexões sobre a pesquisa em educação ambiental no contexto escolar por meio da problematização de metodologias de pesquisa que contemplem as especificidades desse contexto. Nessa direção, alguns aspectos foram emergentes: (1) a imersão no contexto educativo para uma apreensão abrangente da educação ambiental na escola; (2) a compreensão da concepção de educação, individual e coletiva; (3) a compreensão ampla dos desdobramentos da disciplina educação ambiental na Educação Básica; (4) a credibilidade da pesquisa no contexto escolar a partir do retorno dos resultados das pesquisas; (5) a compreensão da epistemologia com ênfase na teoria da complexidade. Embora o campo de pesquisa em educação ambiental no contexto escolar esteja sendo delimitado, consideramos que é necessário primeiro identificar as grandes questões de pesquisa no contexto escolar para então buscar métodos que forneçam respostas.