SARS-CoV-2 shedding, infectivity, and evolution in an immunocompromised adult patient

Authors

  • Maria Cassia Mendes-Correa Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (LIM-52), São Paulo, São Paulo, Brazi https://orcid.org/0000-0001-5655-8108
  • Fábio de Rose Ghilardi Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (LIM-46), São Paulo, São Paulo, Brazil https://orcid.org/0000-0001-9875-2339
  • Matias Chiarastelli Salomão Hospital 9 de Julho, São Paulo, São Paulo, Brazil; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Hospital das Clínicas, São Paulo, São Paulo, Brazil https://orcid.org/0000-0001-5507-0063
  • Lucy Santos Villas-Boas Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (LIM-52), São Paulo, São Paulo, Brazil
  • Anderson Vicente de Paula Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (LIM-52), São Paulo, São Paulo, Brazil
  • Heuder Gustavo Oliveira Paiao Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (LIM-52), São Paulo, São Paulo, Brazil https://orcid.org/0000-0002-4358-1146
  • Antonio Charlys da Costa Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (LIM-52), São Paulo, São Paulo, Brazil https://orcid.org/0000-0001-5516-5177
  • Tânia Regina Tozetto-Mendoza Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (LIM-52), São Paulo, São Paulo, Brazil https://orcid.org/0000-0002-5659-1052
  • Wilton Freire Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (LIM-52), São Paulo, São Paulo, Brazil
  • Flavia Cristina Silva Sales Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (LIM-46), São Paulo, São Paulo, Brazil https://orcid.org/0000-0002-9048-0030
  • Ingra Morales Claro Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (LIM-52), São Paulo, São Paulo, Brazil; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (LIM-46), São Paulo, São Paulo, Brazil https://orcid.org/0000-0001-8637-2910
  • Ester Cerdeira Sabino Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (LIM-46), São Paulo, São Paulo, Brazil https://orcid.org/0000-0003-2623-5126
  • Nuno Rodrigues Faria Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (LIM-46), São Paulo, São Paulo, Brazil; Imperial College, Department of Infectious Disease Epidemiology, London, United Kindgom; University of Oxford, Department of Zoology, Oxford, United Kindgom https://orcid.org/0000-0001-8839-2798
  • Steven Sol Witkin Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (LIM-52), São Paulo, São Paulo, Brazil; Weill Cornell Medicine, Department of Obstetrics and Gynecology, New York, New York, USA

DOI:

https://doi.org/10.1590/

Keywords:

SARS-CoV-2, Cell culture, Evolution, Immunodeficiency, Shedding

Abstract

This study aimed to provide further insight into the evolutionary dynamics of SARS-CoV-2 by analyzing the case of a 40-year-old man who had previously undergone autologous hematopoietic stem cell transplantation due to a diffuse large B-cell lymphoma. He developed a persistent SARS-CoV-2 infection lasting at least 218 days and did not manifest a humoral immune response to the virus during this follow-up period. Whole-genome sequencing and viral cultures confirmed a persistent infection with a replication-positive virus that had undergone genetic variation for at least 196 days after symptom onset.

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Published

2024-05-13

Issue

Vol. 66 (2024)

Section

Case Report

License

Copyright (c) 2024 Maria Cassia Mendes-Correa, Fábio de Rose Ghilardi, Matias Chiarastelli Salomão, Lucy Santos Villas-Boas, Anderson Vicente de Paula, Heuder Gustavo Oliveira Paiao, Antonio Charlys da Costa, Tânia Regina Tozetto-Mendoza, Wilton Freire, Flavia Cristina Silva Sales, Ingra Morales Claro, Ester Cerdeira Sabino, Nuno Rodrigues Faria, Steven Sol Witkin

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This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.

How to Cite

Mendes-Correa, M. C., Ghilardi, F. de R., Salomão, M. C., Villas-Boas, L. S., Paula, A. V. de, Paiao, H. G. O., Costa, A. C. da, Tozetto-Mendoza, T. R., Freire, W., Sales, F. C. S., Claro, I. M., Sabino, E. C., Faria, N. R., & Witkin, S. S. (2024). SARS-CoV-2 shedding, infectivity, and evolution in an immunocompromised adult patient. Revista Do Instituto De Medicina Tropical De São Paulo, 66, e28. https://doi.org/10.1590/