Desenvolvimento de trinta e quatro novos locos de microssatélites e otimização de PCR multiplex de sete locos existentes para Zootoca vivipara (Squamata: Lacertidae)

Autores

  • Jose Luis Horreo University of Lausanne. Department of Ecology and Evolution
  • Maria Luisa Peláez Museo Nacional de Ciencias Naturales. Department of Biodiversity and Evolutionary Biology Centro de Investigaciones Biologicas. Department of Cellular and Molecular Physiopathology
  • Teresa Suárez Centro de Investigaciones Biologicas. Department of Cellular and Molecular Physiopathology
  • Benoit Heulin Station Biologique
  • Patrick Stefan Fitze University of Lausanne. Department of Ecology and Evolution

DOI:

https://doi.org/10.11606/issn.2316-9079.v16i1p89-96

Palavras-chave:

DNA nuclear, Lacerta vivipara, lagarto-comum-europeu, PCR multiplex, NGS, oviparidade, viviparidade

Resumo

Existem poucos locos de microssatélites para o lagarto-comum-europeu, Zootoca vivipara, uma espécie-modelo comum em estudos de dinâmica de populações, seleção sexual, genética de populações, evolução do modo reprodutivo e fisiologia. Os oligonucleotídeos existentes não amplificaram em todas as linhagens, e a reação em cadeia da polimerase (PCR) multiplex não foi otimizada. Um total de 34 novos marcadores polimórficos de microssatélite foi desenvolvido para essa espécie e testado em 64 espécimes dos clados ovíparo e vivíparo (B e D). Os microssatélites foram combinados em sete diferentes agrupamentos . Os resultados mostraram que todos os locos, com uma única exceção, amplificaram com sucesso em todas as amostras e em ambos os clados. O número de alelos detectado por loco variou entre 7 e 22 e o número efetivo, entre 1,58 e 7,82. A heterozigosidade observada variou de 0,312 a 0,930, mostrando que todos os locos foram altamente variáveis. Os clados ovíparo e vivíparo exibiram diferenças genéticas significativas (em FST). Além desses novos marcadores, os sete locos de microssatélite previamente publicados e largamente utilizados foram otimizados em PCR multiplex e testados em clados ovíparos. Essas inovações permitirão análises rápidas e robustas em Zootoca vivipara, impulsionando estudos evolutivos e populacionais e facilitando análises de paternidade

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Publicado

2017-06-28

Edição

Seção

Artigos

Como Citar

Horreo, J. L., Peláez, M. L., Suárez, T., Heulin, B., & Fitze, P. S. (2017). Desenvolvimento de trinta e quatro novos locos de microssatélites e otimização de PCR multiplex de sete locos existentes para Zootoca vivipara (Squamata: Lacertidae). Phyllomedusa: Journal of Herpetology, 16(1), 89-96. https://doi.org/10.11606/issn.2316-9079.v16i1p89-96