Em 18 de novembro de 1988, o Programa de Apoio às Publicações Científicas Periódicas da Universidade de São Paulo teve seu Regimento aprovado a partir da Portaria GR n. 2.403 http://www.leginf.usp.br/?portaria=portaria-gr-no-2403-de-13-de-dezembro-de-1988-publicada-em-22111988
Em 18 de dezembro de 2006, a partir da Portaria GR n. 3.726, foi regulamentada a Comissão de Credenciamento do Programa http://www.leginf.usp.br/?portaria=portaria-gr-no-3726-de-18-de-dezembro-de-2006
Em 2008, o Portal de Revistas USP foi desenvolvido com o objetivo de reunir, organizar e promover o acesso aberto aos periódicos científicos publicados sob a responsabilidade da Universidade, ampliando sua visibilidade e acessibilidade em âmbito nacional e internacional.
Em 2012, foi lançado o novo Portal de Revistas da USP, elaborado em WordPress e OJS, um sistema opensource, interoperável com outros sistemas nacionais e internacionais, além de possibilitar a indexação por ferramentas de busca como o Google Scholar, o que amplia a visibilidade da produção intelectual da USP. O novo Portal de Revistas da USP garantia o acesso aberto a textos completos de 104 títulos de revistas credenciadas editadas pela Universidade, e possibilita a obtenção de indicadores da produção científica, como relatórios de índices de citação e de coautoria, além de ampliar sua visibilidade.
Anualmente, o Programa de Apoio às Publicações Científicas Periódicas da USP publica Edital que visa apoiar projetos de editores USP que tenham por objetivo o aperfeiçoamento de seus periódicos nos seguintes aspectos: aumento do fator de impacto, internacionalização e produção editorial (incluindo diagramação, tradução, revisão gramatical e, excepcionalmente, impressão).
Em 25 de outubro de 2017, a Resolução Nº 7.418 disciplinou o Programa de Apoio às Publicações Científicas Periódicas da USP no Sistema Integrado de Bibliotecas e substituiu a Comissão de Credenciamento pelo Comitê Científico. http://www.leginf.usp.br/?resolucao=resolucao-no-7418-de-25-de-outubro-de-2017